กล้องจุลทรรศน์เป็นเครื่องมือทางแสงที่ประกอบด้วยเลนส์หรือเลนส์หลายตัวรวมกัน ซึ่งเป็นสัญญาณว่ามนุษย์ได้เข้าสู่ยุคปรมาณูแล้ว กล้องจุลทรรศน์เป็นเครื่องมือที่ใช้ขยายวัตถุขนาดเล็กซึ่งสามารถมองเห็นได้ด้วยตามนุษย์เป็นหลัก สเปกโทรสโกปีสเปกโทรสโกปีและกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน: กล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงได้รับการบุกเบิกในปี ค.ศ. 1590 โดยเจนเซนแห่งเนเธอร์แลนด์ กล้องจุลทรรศน์แบบใช้แสงในปัจจุบันสามารถขยายวัตถุได้ 1600 เท่า ขีดจำกัดขั้นต่ำของความละเอียดอยู่ที่ 1/2 ของความยาวคลื่น และความยาวของท่อเชิงกลของกล้องจุลทรรศน์ที่ใช้ในบ้านโดยทั่วไปคือ 160 มม. บุคคลที่มีส่วนร่วมอย่างมากในการพัฒนากล้องจุลทรรศน์และจุลชีววิทยาคือ Leeuwenhoek ชาวเนเธอร์แลนด์